Le Teenage Mutant Ninja Turtles, ora adolescenti ribelli, si trovano a dover affrontare una nuova minaccia: una gang di motociclisti che terrorizza New York, rubando e vandalizzando senza pietà. Mentre Leonardo, Michelangelo, Donatello e Raffaello cercano di mantenere la loro identità segreta, la loro vita da ninja viene complicata dai conflitti tra il dovere e il desiderio di divertirsi. La tensione cresce quando i ragazzi scoprono che la gang ha legami con un oscuro passato che coinvolge il loro maestro Splinter, portandoli a una resa dei conti decisiva.