In un'America segnata da tensioni politiche e sociali, "COINTELPRO 101" esplora le operazioni clandestine dell'FBI contro attivisti e movimenti per i diritti civili dagli anni '50 agli anni '70. Attraverso interviste e materiali d'archivio, il documentario rivela le strategie subdole utilizzate per infiltrare e discreditare gruppi come il Black Panther Party e gli studenti universitari. Il conflitto centrale si snoda tra la lotta per la giustizia sociale e le manovre governative tese a mantenere il controllo, offrendo uno sguardo inquietante sul potere e sulla resistenza.